Giudicato da molti addetti ai lavori come un ottimo attaccante di movimento, con grandi qualità tecniche, muove i suoi primi passi da professionista nel Partizan Belgrado, con cui disputa due grandi stagioni.
Passa alla Fiorentina e a soli 18 anni esordisce in Serie A dimostrando tutto il bene che di lui si dice in giro.
Giocatore molto "vivace" anche dal punto disciplinare, durante una partita tra la Fiorentina e il Novara, viene sostituito dal suo tecnico Delio Rossi e lui non gradisce molto: applaude sarcasticamente il proprio tecnico e si accomoda in panchina, ma il diverbio continua e sfocia in una vera e propria aggressione fisica del giocatore da parte dell'allenatore.
Al termine della gara la Fiorentina esonera immediatamente il tecnico e mette fuori rosa il giocatore.
La stagione successiva, con Montella in panchina, Ljajic si mette in mostra talmente tanto da convincere la dirigenza viola a reintegrarlo in rosa e lui ripaga la società disputando la sua migliore stagione sia sotto il profilo realizzativo che di continuità.
In effetti il suo problema maggiore e la scarsa continuità di rendimento e una sorta di svogliatezza dimostrata in parecchie gare in cui non è ispirato.
Problema che continua ad essere evidente anche dopo il suo trasferimento alla Roma.
In giallorosso, come già fatto in passato, alterna ottime prestazioni a partite completamente anonime, che ne mettono in dubbio la sua reale bravura e il suo reale valore.
Dopo due stagioni all'ombra del Cupolone, la Roma lo manda prima in prestito all'Inter (dove continua a non essere troppo incisivo) e infine si accasa al Torino.