Pierino la Peste: così diventa universalmente noto negli anni '60, dopo l'esplosione col Milan.
In rossonero forma una coppia straordinaria con Gianni Rivera, che fa le fortune di Rocco: gli inviti del regista alessandrino vengono capitalizzati ogni volta nel modo migliore da Prati e grazie alla loro incredibile intesa, il Milan arriva sul tetto del mondo. Negli occhi di tanti sportivi italiani, rimane in particolare il ricordo della finale di Coppa dei Campioni del 1969, quando Rivera e Prati distruggono al Santiago Bernabeu l'Ayax dell'astro nascente Cruiyff.
Dopo il 1971, una serie di problemi fisici frenano però la sua ascesa, durante la quale ha vestito anche la maglia azzurra e, nel 1973, il Milan decide di cedere alle avances della Roma, alla ricerca di un forte attaccante in grado di finalizzare al meglio il gioco del centrocampo.
Nella sua prima stagione, ancora una volta Prati viene frenato dai problemi fisici, tanto che molti lo bollano come giocatore ormai finito, ma nel corso della seconda annata, esplode in tutta la sua forza e traina la squadra allenata da Liedholm al terzo posto finale.
Forte in acrobazia, potente, rapido sul breve, la sua caratteristica migliore è probabilmente il tiro. Quando prende bene la palla, anche da grande distanza, sono problemi seri per i portieri. Purtroppo, il suo fisico è ormai usurato e quel 1974-75 diventa il canto del cigno.